L’ASNOM tient chaque année son Congrès annuel dont l’organisation est confiée à l’une de ses sections. Cet évènement qui s’étale sur deux journées donne lieu à l’Assemblée générale de l’association qui se déroule conformément à ses statuts et à laquelle sont conviés les membres actifs ou associés à jour de leur cotisation. Une journée est ensuite consacrée à des activités ludiques et/ou touristiques sous forme d’excursions ou de visites auxquelles participent les accompagnants des congressistes.
Ce Congrès représente un moment important et incontournable de rencontres et de convivialité entre anciens élèves des écoles de santé militaires issus des diverses sections de l’Amicale.
La participation à ce Congrès passe par une inscription qui s’effectue dans les mois qui précèdent l’évènement et implique que chaque participant procède aux frais générés par les diverses activités qu’il a choisi de suivre.
Au cours des 10 dernières années, le Congrès s’est déroulé successivement à Marseille (2013), Biarritz (2014), Rochefort (2015), Toulon (2016), Brest (2017), Lyon (2018) , Bastia (2019), annulé en 2020 et 2021, Rochefort (2022), Saint-Jean de Luz (2023). Il a eu lieu à Marseille, au Pharo, les 25 et 26 septembre 2024 et est prévu à Paris, à l’Ecole du Val de Grâce, les 5 et 6 juin 2025.